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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 数据网络药学学折射出草酸钙肾结石腐蚀应激性和炎症病变磨损机制化

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿机设计常用见的妇科疾病中的一个。肾机构中CaOx结晶体过达到饱和状态沉淀积累会造成 肾小管血细胞问题和凋亡,故而造成 肾结石的变成。短链人体乳酸酸由胃胃肠内活性污泥菌堆肥营养膳食钎维引发,不禁在轮廓线胃胃肠障壁中展现角色,另一方面在机设计平行上也展现要素角色。进来,丁酸是最充足的短链人体乳酸酸,具备有免疫性促使和免疫性促使角色,本探索试论丁酸对CaOx肾结石的角色十分内在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗机构泌尿美容外科吴忠专家教授、周子健硕士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网络上药学学业务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

篇文章分类:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 投资者机关单位:华山医疗 探讨关键字:大鼠、HK-2受损细胞 分成小组短信:相较比较组(Con)、模板组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱出示科技:网洛药学学探测

理念具体流程图模板

深入分析报告

学习人工先要融合大鼠对实体实体模型,进行女性生理生化学指标图和企业病理报告学复染等学习法律手段察觉到丁酸不错才能减少CaOx对实体实体模型大鼠肾CaOx结晶的型成和伤到,有所改善CaOx对实体实体模型大鼠的真菌感染伤到和钝化的东西的太过抒发。显然,丁酸还可有抑制草酸诱骗的HK-2肿瘤体细胞伤到、钝化的应激状态和肿瘤体细胞凋亡。 为与探讨丁酸空间成分和靶人类DNA网咯,研发人士从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和3D空间成分(图1A)。按照PharmMapper统计数剧显示库和Uniprot统计数剧显示库处里后共建立出11八个丁酸靶人类DNA供进三步阐述。将人类DNA全部倒入STRING统计数剧显示库,实施PPI网咯阐述。Cytoscape列出了顺序的前20的核心靶人类DNA的详细介绍网咯图,具有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。那些核心人类DNA与网咯中的其它的人类DNA均的表现出必须的极为必要性性,原因阐述那些人类DNA也许利用出来着联合功效。GO和KEGG阐述体现了了丁酸核心人类DNA的极为必要性路经和生物工程制品学职能(图1C)。核心人类DNA主耍与类固醇生长生长激素对答、被被氧化应激性不良发生症状对答、生物工程酶类氧受损细胞对类固醇生长生长激素有趣的不良发生症状已经对咸性电化学杂质的不良发生症状有关的。笔者认为笔者认为,那些核心人类DNA主耍进行了被被氧化应激性不良发生症状和对生物工程酶类氧的生物工程制品不良发生症状时候,是肾结石生成考核机制中至关极为必要的路经,这反映出丁酸也许在肾结石中利用出来极为必要功效。

图1| 丁酸的结构与靶dna网洛介绍(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步骤深入阐述探讨丁酸对CaOx肾结石.切靶人类遗传表观遗传,深入阐述探讨对应对应职工凭借GEO数据文件文件库对GSE73680中身体健康较与CaOx肾结石求美者的人类遗传表观遗传异同经过了深入阐述探讨。较组与CaOx结石求美者的对应性性异同体现人类遗传表观遗传(DEGs)dna检测细则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个人类遗传表观遗传会发生对应性的变化,其中的3379个(89.4%)人类遗传表观遗传体现调整,404个(10.6%)人类遗传表观遗传体现变动(图2A)。对DEGs经过聚类分析阐述法阐述,热图显视了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析阐述法功能(图2B)。接着随后,深入阐述探讨对应对应职工经过GeneCards数据文件文件库人为鉴定结论了370个已经与CaOx肾结石对应的人类遗传表观遗传,排明前20位的分析人类遗传表观遗传试述对应性评级下图2C所显示。要为找自己丁酸疗法CaOx肾结石的重要的靶点,深入阐述探讨对应对应职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石对应人类遗传表观遗传净化处理取得一个多个Venn图。结果是,CYP2C9被判断为丁酸危害CaOx肾结石的隐藏靶点(图2D)。除外,深入阐述探讨对应对应职工还经过了丁酸与CYP2C9的碳原子连接,CYP2C9的6个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为使用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用线上药剂学学预测分析CYP2C9是丁酸作用CaOx肾结石的靶什么是基因后,学习者还可以通过肿瘤血细胞试验声明了CYP2C9可影响草酸介导的HK-2肿瘤血细胞的ROS水平方向、发炎直接损伤和凋亡。

图2| 大部分据库结合阐述估计CYP2C9是丁酸效用于CaOx肾结石的靶什么是基因

调查結果

本论述应当出现 丁酸在身体外和体内的均能遏制CaOx肾结石模特的被氧化反应应激反应性和疾病板材损害,继而经过互联网药剂学学建立获取丁酸会影响CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,另外经过受损神经元检测灵魂存在CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2受损神经元ROS的水平、疾病板材损害和凋亡。此类出现 证明丁酸已经经过遏制CYP2C9来遏制CaOx肾结石的被氧化反应应激反应性,调低疾病板材损害。这类的时候中拜谱生态学打造了互联网药剂学学枝术业务,还有就是拜谱生态学可不断提高较为成熟改善的dna组学、血清质组学、细胞代谢组学等多个学产品的及枝术业务,追捧呼叫资讯! 参考使用文章:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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