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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

总是看作矿业辅料而被熟记的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄危化物”变为“神秘宝藏小分子结构”的苦不堪言发展历程类似,有一天近二十些年才被得知其首要的分子生物学学用途,从此之后“平躺农奴把声乐”,格外是在免疫细胞支原体感染病变性病毒设计前沿技术内推陈出新。现有几篇论文范文宣传报道了在所有支原体感染病变性病毒的猎物对模型中受到衣康酸或其物理化学装饰衍分子生物学的冶疗益处,并得知其隐性靶点。就衣康酸的“前世姻缘”与“今生今世”,详细文案《乳酸的实现逆袭哥哥——衣康酸!本文让你带你飞分析衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖球蛋白组学产品,实现1000+艰深度掩盖位点检测,不稳定性复现經典靶点,全周边所有地方生信定量分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现了”到“效验”全流程步骤服務,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验室流程图

02、测试数据文件

03、经“点”复现

在测量数据源中,检测出很多医学文献中报到的典型靶点及衣康酸装饰位点,如独这个被发现了的衣康酸共价装饰血清KEAP1,有糖酵解信号通路中的3个根本酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体组成了血清NLRP3和细胞核萎缩整个过程中的根本血清RIPK3等,其质谱图以下图如图是。

04、护肤品特性

1.众多质控

金融业化特女性朋友测试探针孵育、SDS-PAGE监测工具、WB查证、样板相应的性分享等供需双位子监测工具,抓好品牌毕竟靠得住性。

2.高功效质谱实验仪器网站

在Orbitrap Astral全第七代人高辩认质谱仪六道金刚咒下,保持衣康酸性反应淡化位点及蛋清亲子鉴定新深度的,注力数学研究分析新会发现。

3.全注意事项站台式服务于

依据拜谱海洋生物逐步完善的实验所安全服务平台,可具备“组织细胞致力于→检侧器孵育→WB检侧→艰深度衣康碱化掩盖检侧→vip专享生信剖析→单一位点PRM认证”全标准流程安全服务,省时省劲更贴心。

05、分折內容(部份)

06、用方位

PART 2、论文资料探讨

论文资料一

英语翻译小标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名小标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探究项目:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

期刊论文二

用英文怎么说微信标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

简体中文标题格式:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探究方式:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典例随之出现策略

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备有较弱的底物结合实际效率,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱菌物衣康过酸绘制组评测统计资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用修饰语(内容如下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

有所作为TCA反复的中的后面分泌物,衣康酸转换分泌、免疫检测系统检测和宫颈支原体感染范围内的充分功效,为医疗免疫检测系统检测宫颈支原体感染型疾患症状给予了使用医疗攻略 。衣康酸格局中的亲电性α,β-不趋于稳定羧酸格局能对核营养素上的特异性半胱氨酸残基对其进行烷基化绘制(迈克尔减伤响应),这样翻译工作后绘制被通称“衣康酸绘制(itaconation)”,而使决定核营养素功用,调节作用免疫检测系统检测对答和分泌路线,为许多疾患症状肿瘤药物创新给予新想法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用装饰蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医美肯定一定量靶向药物代谢转化组(QMT1000)或力量产生靶点产生组产品设备对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

学习学术论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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